新京报
将样本序列与人、猪、狗的参考序列分别比对,重点观察覆盖长度、匹配比例、错配位置和测序质量。只有在目标🔑区域覆盖充分、质量合格,并且与某一物种具有明显更高的一致性时,才能支持物种归属。
DNA“纯度”至少包括两层含义:一是提取液中DNA是否受到蛋白质、盐、酚、乙醇等杂质影响;二是样本是否混入了其他物种或其他个体的DNA。前者属于化学纯度,后者属于生物学纯度,二者不能混为一谈。
若目标是区分人、猪和狗,应优先选择具有物种特异性的标记,而不是随意截取一❤️段序列。线粒体DNA中的部分区域常用于物种识别,因为拷贝数相对较高;但不同项目适合的区域并不完全相同,食品、法医学和动物研究所用方案也可能不同。
实验室可以通过荧光法或吸光度🎊法测定DNA浓度,并结合A🌟260/A280、A260/A230等指标初步观察杂质情况。但吸光度容易受到RNA、残留试剂和低浓度样本影响,不能仅凭一个比例确认样本适合测序。