新华社
血液、唾液和新鲜组织的DNA通常保存相对较好,可以先提取总DNA,再进行物种特异性qPCR或PCR筛查,必要时用核DNA位点和线粒体片段进行复核。新鲜样本还应设置提取空白、扩增阴性对照和已知物种阳性对照,以排除试剂和操作污染。
混合样本应把“是否存在某物种”和“样本主要来自某✨物种”分开判断。人、猪、狗的DNA同时出现时,单个峰图或单个测序结果可能只反映其中一部分来源,需要采用多物种qPCR、混合物SNP面板或高通量测⭐序,并结合峰高、等位基因比例、测序深度和重复结果分析。
线粒体DNA适合人、猪、狗的物种初筛,因为每个细胞通常含有多份线粒体基因组,样本轻度降解时更容易检测到有效片段。实验室常选择细胞色素b、COI或其他经过验证的片段,将扩增产物测序后与可靠的物种参考序列进行比对。
线粒体DNA的优势是灵敏度较高、片段可以设计得较短,缺点是只能反映母系遗传。近缘个体之间可能共享相近的线粒体单倍型,样本受到少👍量外源DNA污染时也可能产生混合峰。因此,线粒体结果适合回答“更符合哪个物种”,不适合单独回答“具体来自哪个人、哪个品种或哪只动物”。
熟肉、烹调组织和高度腐败样本需要使用短片段标记。高温会使DNA断裂,腐败会引入大量微生物DNA,复杂调味料还可🚀能抑🌟制PCR。此类样本宜先做短片段物种筛查,再用独立靶标复核,不能因为一次弱阳性扩增就直接下结论。